临床医学院办学可追溯至1951年创办的晋江医士学校西医士专业。2006年设立临床医学系，2016 年更名为临床医学院。学院目前开设临床医学、中医学、康复治疗技术、医学影像技术、针灸推拿五大专业，其中临床医学专业办学历史最为悠久，是本校底蕴深厚、特色鲜明的传统优势专业。学院恪守 “勤谨励学，尚德惠世” 院训，深耕医学教育沃土，坚守育人初心，聚力培育品德优良、医术扎实的高素质应用型医疗卫生专业人才。

学院下设综合办公室、教务科、学生科3个管理部门，以及内科学、诊断学、外科学、妇产科学、儿科学、中医学、康复治疗学、针灸推拿、医学影像学、眼视光学、实验教学中心共11个教研室，构建了完善的教学管理与学科建设体系。现有教职工74人，其中专任教师60人、实验员5人、辅导员9人。专任教师队伍结构合理、素养优良，其中教授2名，副高级职称（含副主任医师）15名，中级职称（讲师）18名，初级职称（含未定级）25名，高级职称占比达28.3%；学历层次稳步提升，博士6人，占专任教师总数的10%，硕士44人（含博士在读4人），占比73.3%；实践能力突出，双师型教师50人，占专任教师的83.3%，为高质量教学提供了坚实保障。

办学成果丰硕，斩获各类荣誉资质多项。其中国家级荣誉及成果6项，包括国家级临床医学专业教学团队、国家高校应用技术协同创新中心、国家级职业教育示范性虚拟仿真实训基地、国家医师资格考试实践技能考试基地、国家教学资源库4门课程、全国1+X试点项目及全国高校活力团支部TOP100；省级荣誉13项，涵盖省级优秀教学团队、省级高水平专业群、省级临床专业教学资源库、福建省高校应用技术工程中心、福建省高职院校应用技术协同创新中心、省级高等职业教育教学改革综合试验项目、省财政支持高等职业教育实训基地、省级高职精品专业、省级高等职业教育示范专业、省级高等职业教育生产性实训基地，以及省级精品课程8门、省级精品在线开放课程2门、“福建省模范职工小家”，彰显了学院强劲的办学实力。

教学科研协同发展，成效显著。近几年来，学院荣获省级教学成果奖一等奖1项、二等奖2项；教师在全国行业教师教学能力比赛中表现优异，斩获特等奖1项、一等奖2项、二等奖2项；指导学生参加全国行业技能大赛，1人获评优秀指导教师。教师积极投身教材编写与科研创新，参编教材29部，其中主编人民卫生出版社教材9部；获批市级以上项目课题66项，发表论文446篇，其中SCI论文82篇、核心论文164篇，获得省、市级科技成果奖6项，取得国家专利授权及软件著作权30项，持续推动学科建设与教学质量双向提升。

学院深化“校院合作、产教融合”人才培养模式改革，着力打造应用型医学人才培养高地。自2007年起，临床医学专业与多家医院合作，创新设立“1+1+1”教学模式，并结合行业人才需求，开设全科医学、超声医学、精神康复、呼吸治疗技术四大方向班，实现校企协同、精准育人；后续，康复治疗技术、针灸推拿、中医学专业相继与多家优质医院合作开设教学班，进一步拓展了实践教学路径。同时，学院积极拓展国际合作，中医学、针灸推拿专业面向东南亚“一带一路”沿线国家招生，其中针灸推拿专业已成功培养一届留学毕业生，为中医药文化国际传播与交流贡献力量。