泉州医高专成人教育创办于1999年。随着医学成人教育的发展，学校于2006年设立成人教育部，2016年更名为继续教育学院。学院始终坚持规范与发展并重，突出医药卫生办学特色，以服务全民终身学习为宗旨，为区域医药卫生事业高质量发展提供坚实人才支撑。学院主要工作为高等学历继续教育、非学历教育培训、自考本专衔接助学、技能人才评价四大部分。

学校成人学历教育始于1999年与福建医科大学联合举办的高护（专科）函授班。2006年起，经福建省教育厅批准，开设护理、药学、临床医学、中医学、医学检验技术、医学影像技术、公共卫生管理、医药营销、康复治疗技术、中药学等10个专科专业。2008年起，与福建医科大学、福建中医药大学开展高等学历继续教育本科合作办学，开设护理学、中医学、康复治疗学等8个专升本专业。办学至今，累计培养本专科毕业生近万名。2017年、2018年获得福建省教育厅继续教育示范教学点立项。

2013年学校与福建医科大学成教学院联合开展自学考试本专衔接助学班，首批开设护理学、药学2个专业。办学至今，共767名学生获得自学考试本科毕业证书，468名学生获得学士学位。

学校主动服务区域经济社会发展，开展非学历教育培训服务。联合泉州市医疗保障局共建成立国内首家医疗保障学院，联合泉州市民政局共建成立泉州市养老服务人才教育培训基地，同时建有福建省乡村医生培训分中心、泉州市医疗护理员培训中心、福建省退役军人职业技能培训机构、泉州市专业技术人员继续教育基地等。2021年以来，累计开展各类培训25万余人次，打造出医保培训、养老护理人员培训等高质量、影响力大的职业培训品牌。

学校积极拓展社区教育、老年教育，获得国家级终身教育成果2项、省级终身教育成果4项，获批国家级终身教育项目2项、省级终身教育项目5项。

学校持续完善技能人才评价体系，推动学历教育与职业培训深度融合。2003年成立职业技能鉴定站，2020年入选福建省首批职业技能等级认定试点院校，2023年获批福建省专项职业能力统一考核考点，2025年获批厦漳泉片区长期照护师职业技能等级认定分考点资质。目前开展医疗护理员、养老护理员、健康照护师、老年人能力评估师、育婴员、保健按摩师、食品检验员、医药商品购销员等11个职业（工种）职业技能等级认定，保健推拿、膳食营养搭配、老人照护、病患陪护等4个专项职业能力考核项目，情绪疏导、家庭教育指导、创新创业、升学指导等16个项目的专项职业能力统一考核。鉴定站成立以来，学校累计开展技能人才评价3万余人次。